Фамилия Бурдыко звучит как типичная украинская или белорусская, и это подтверждает её состав. Суффикс -ко — один из самых распространённых в западнорусских землях, он образует фамилии от прозвищ и имён, указывая на принадлежность или связь с человеком, названным этой основой. В данном случае основа — Бурдык (или Бурда).

Слово «бурда» в старых говорах означало не просто мутную жидкость, а хмельной напиток, брагу или пиво домашней варки. Поэтому первая и самая прямая версия: прозвище Бурда, от которого пошла фамилия Бурдыко, могли дать любителю выпить, знатоку хмельного или, наоборот, тому, кто варил этот напиток. В крестьянском быту умение сварить добрую брагу ценилось, и такое прозвище не обязательно было обидным — скорее, характеризовало занятие или привычку.

Есть и другая, менее очевидная версия, которую иногда приводят в ономастике. Слово «бурда» в некоторых диалектах связывали с понятием «землянка» или «глинобитное жильё». Отсюда Бурдыком могли прозвать человека, который жил в землянке, либо строителя — мастера по возведению таких построек. Эта гипотеза слабее, потому что основное значение «хмельной напиток» зафиксировано в словарях шире, а «землянка» — лишь локальное ответвление смысла.

Словообразовательная модель проста: к основе Бурд- добавился суффикс -ык (указывающий на носителя признака), а затем фамильный патронимический суффикс -о. Изначально Бурдыко — это «сын Бурдыка» или «человек из рода Бурды». Фамилия довольно редкая, её географическое ядро, скорее всего, находится на территории современной Беларуси или западной Украины, где суффикс -ко особенно активен. Встречаются и параллельные формы — Бурда, Бурденко, Бурдюк, но Бурдыко отличается именно этим редким промежуточным элементом -ык-, что делает её легко узнаваемой среди однокоренных.