Оно может брать начало от глагола burti, который в переводе с литовского языка на русский означает «ворожить, колдовать». Вероятно, именование Бурдыс принадлежало знахарю. Знахарем в старину называли деревенского лекаря, умевшего врачевать недуги и облегчать телесные страдания не только людей, но и животных. Возможно также, что фамилия Бурдыс является вариантом фамилии Бурд, адаптированной прибалтами. В свою очередь, фамилия Бурд происходит от аналогичного прозвища. Оно восходит к германской основе burd со значением «борд». Вероятно, именование Бурд принадлежало тому, кто жил недалеко от брода. Среди известных однофамильцев можно назвать американского писателя-фантаста литовского происхождения Алгирдаса Йонаса Бурдыса.