Фамилия Бутнина — женская форма, а мужская, соответственно, Бутнин. С точки зрения словообразования всё прозрачно: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть «сын Бутни» или «дочь Бутни». А вот с основой «Бутня» начинается самое интересное.

Скорее всего, Бутня — это не имя, а прозвище. В русских говорах слово «бут» или «бута» имело несколько значений. В архангельских и сибирских диалектах «бут» — это каменная закладка, бутовый камень, то есть основание фундамента. Прозвище Бутня могли дать крепкому, основательному человеку, «каменному» по характеру, либо каменщику, работавшему с бутовым камнем. Вторая версия связана с глаголом «бутить» — наполнять чем-то, заваливать. В переносном смысле так могли назвать неряшливого человека, который «бутит» в доме всё подряд, или, наоборот, того, кто занимался засыпкой, закладкой чего-либо.

Есть и менее очевидный, но любопытный вариант: в некоторых говорах «бутня» — это бочонок, кадка. Тогда прозвище могло относиться к бондарю или к человеку плотного, «бочкообразного» телосложения. Фамилия редкая, и географически она тяготеет к северным регионам России — Вологодской, Архангельской областям, а также к Уралу, где слово «бут» в значении «камень» было в ходу.

Важно, что фамилия Бутнин (Бутнина) не имеет никакого отношения к западноевропейским корням или к фамилии Бутенко. Это исконно русская модель, образованная от местного, диалектного прозвища. Предки носителей этой фамилии, скорее всего, были людьми труда — каменщиками, строителями или ремесленниками, а прозвище цепко держалось за род, превратившись со временем в официальную фамилию.