Фамилия Чокуева — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. Основа фамилии — «Чокуй» — не встречается в святцах и не образуется от распространённых славянских прозвищ. Скорее всего, перед нами топонимическая фамилия, указывающая на выходца из конкретного места.

Ключ к разгадке — река Чокуй. Это левый приток Лены, протекающий в Иркутской области и Якутии. В бассейне Лены издавна жили русские старожилы, промышлявшие охотой и рыболовством. Прозвище «Чокуй» могли дать человеку, который пришёл с этой реки или жил на её берегах. Суффикс «-ев» (вариант «-ов» после мягкого согласного) — стандартный русский патронимический или посессивный формант, образующий фамилию по отцу: «чей?» — Чокуев, то есть сын или потомок Чокуя.

Менее вероятна, но возможна тюркская версия. В тюркских языках, особенно в киргизском и алтайском, слово «чоку» может означать «вершина», «макушка», «холм». В таком случае «Чокуй» — прозвище человека, жившего на возвышенности, или метафорическое (острый, как вершина). Однако географическая привязка к конкретной сибирской реке выглядит убедительнее: топонимические фамилии в Сибири образовывались именно по такой модели, и фамилия Чокуева органично вписывается в ряд однокоренных сибирских фамилий Чокуевы, Чокуйские.

Фамилия очень редкая. Её носители, скорее всего, потомки сибирских старожилов или переселенцев, чьи предки получили прозвище по месту обитания на реке Чокуй в Восточной Сибири.