Фамилия Чункина — женская форма фамилии Чункин, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. Основа здесь — прозвище или некалендарное имя Чунка. В русских говорах слово «чунка» имело несколько значений. В архангельских и сибирских диалектах так называли небольшие сани-дровни, а в некоторых местах — деревянную колодку для отбивания косы или даже неуклюжего, медлительного человека. Скорее всего, прозвище дали либо по роду занятий (изготовитель саней или косец), либо по внешней особенности или характеру.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чункин — это «сын Чунки» или «человек из семьи Чунки». Такая модель образования типична для русских фамилий, возникших от прозвищ или уменьшительных форм крестильных имён. Интересно, что Чунка могло быть и производным от имени Чуня — так в старину называли детей с ласковым оттенком, но здесь корень другой, без смягчения.

Географически фамилия редкая, её очаги, по данным современных исследований, тяготеют к северным и центральным областям России — Вологодской, Кировской, Нижегородской. Это совпадает с ареалом диалектного слова «чунка». Встречаются и варианты написания с одной «н» — Чукина, но это уже совсем другая этимология, от имени Чука (уменьшительное от Николая или Георгия).

В целом, носительница фамилии Чункина может считать, что её предок, скорее всего, был либо крестьянином-северянином, знавшим толк в санях или косьбе, либо получил прозвище за свою медлительность — в любом случае, корень уходит в живую народную речь, а не в книжные святцы.