Фамилия Давыдкин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от имени через суффикс -ин. В основе лежит уменьшительная форма Давыдка от православного крестильного имени Давид (в народном произношении — Давыд). Исходное древнееврейское имя означает «любимый», но для понимания фамилии важнее не перевод, а то, что Давыдка — это не официальное, а обиходное, домашнее прозвище человека.

Суффикс -ин в фамилиях традиционно указывал на принадлежность: «чей сын?» — Давыдкин, то есть сын Давыдки. Такая модель была особенно характерна для северных и центральных областей России, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на юге и востоке. В отличие от фамилий на -ов (например, Давыдов), форма Давыдкин закрепилась в тех регионах, где было принято называть людей по уменьшительному имени, а не по полному.

Примечательно, что фамилия Давыдкин не получила массового распространения, в отличие от Давыдов или Давыденко. Это говорит о том, что её носители происходят из относительно компактной локальной группы — возможно, из одной деревни или волости, где имя Давыдка было в ходу среди нескольких семей. В документах XVI–XVII веков встречаются упоминания крестьян и посадских людей с таким именем, но фамилия в её современном виде оформилась, скорее всего, не раньше XVIII века, когда окончательно закрепилась трёхчленная формула имени.

Социально предки Давыдкиных — скорее всего, крестьяне или ремесленники, так как в дворянской среде предпочитали более полные формы имени (Давыдов). В некоторых говорах имя Давыд произносили с ударением на первый слог, что могло повлиять и на произношение самой фамилии. Сегодня фамилия встречается в основном в центральной России и Поволжье, но точная география требует отдельного исследования по архивным переписям.