Фамилия Дениченко образована от имени собственного Денис, которое является славянским вариантом древнегреческого имени Дионисий. В греческой мифологии Дионис — бог виноделия, плодородия и жизненных сил природы, поэтому имя было широко распространено в христианской традиции. Дениченко буквально понималось как «сын Денича»: в основе лежит производная форма Денич (Денис), к которой добавился украинский суффикс -енко. Этот суффикс, один из самых частых в украинской ономастике, первоначально означал «маленький» или «сын», то есть указывал на родство по отцу. Со временем он перестал восприниматься как уменьшительный и закрепился в фамилиях как наследственный признак.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев или -ин, модель на -енко характерна для Украины, особенно для её левобережных и центральных регионов. Дениченко — типичная фамилия из этой группы, указывающая на то, что предок носителя был сыном человека по имени Денис или Денич. Географически фамилия чаще всего встречается в Полтавской, Черниговской и Киевской областях, что подтверждает её украинское происхождение. В российских переписях XVIII–XIX веков носители фамилии Дениченко фиксировались в основном среди казаков и крестьян южных губерний, например в Курской и Воронежской.

Если разбирать словообразовательную модель, то суффикс -енко в украинских фамилиях выполнял роль отчества. В белорусской традиции ему соответствует суффикс -еня (Денисеня), а в польской — -ицкий (Деницкий). Интересно, что фамилия Дениченко не имеет вариантов с твердым окончанием (как Дениченков) — это указывает на её устойчивую украинскую форму, которая не подверглась русификации. Встречается также редкая орфографическая особенность: в старых документах фамилию могли записывать как Денищенко или Денишченко, что связано с диалектным произношением.

Спорных версий о происхождении фамилии практически нет: корень Денис- прозрачен, а суффикс -енко однозначно указывает на украинскую модель. Единственное, что стоит отметить — в редких случаях фамилия могла возникнуть не от имени Денис, а от прозвища Денич (например, от слова «денич» в значении «денщик» в некоторых говорах), но эта гипотеза слабая и не подтверждается массовостью фамилии. Правдоподобнее считать, что Дениченко — это патронимическая фамилия, которая закрепилась за потомками человека по имени Денис.