Фамилия Дергун ведет свое начало от прозвища Дергун. Скорее всего, так прозвали человека, страдавшего недугом, который сопровождался судорогами и постоянным подергиванием. Возможно, что такое шутливое прозвище получил кривляка и насмешник. Дергуном в некоторых говорах также называли деревянный или железный крюк, которым дергали из стога сено. Можно предположить, что прозвище Дергун указывало на внешние особенности его обладателя – сутулость, долговязость, неуклюжесть. Одно из первых упоминаний родственной фамилии относится к концу XV в.: в «Ономастиконе» С.Б. Веселовского записан Дергунов Тимофей, крестьянин, 1495 г., Новгород.