Фамилия Дейкин образована по стандартной русской модели от личного имени Дейка. Это уменьшительно-ласкательная форма старинного крестильного имени Дей (в более правильной транскрипции — Дий). Имя Дий происходит от греческого слова «диос», то есть «божественный». Выбор такого имени для ребенка в старину, скорее всего, связывали с пожеланием славы, почета, силы и могущества. Интересно, что у древних славян существовало языческое божество по имени Дий, которое считалось богом неба, что добавляет имени дополнительный смысловой оттенок.

По социальному происхождению основатель рода Дейкиных, вероятнее всего, был человеком из простого сословия. Фамилии на -ин в основном закреплялись за крестьянами и посадскими людьми, указывая на принадлежность к отцу или главе семьи. Суффикс -ин указывает на то, что родоначальника звали Дейка, а его потомки стали «Дейкиными детьми».

Существует и вторая, не менее правдоподобная версия: в основе фамилии могло лежать не церковное имя, а мирское прозвище Дей. Такое прозвище могли дать энергичному, деятельному человеку — от глагола «деть», «деять» (делать, действовать). В этом случае фамилия напрямую указывает на характер или род занятий предка, который был известен своей активностью и трудолюбием.

Точное место и время возникновения фамилии Дейкин установить сложно, так как процесс закрепления фамилий на Руси растянулся на несколько веков. Однако сама словообразовательная модель и редкое имя-основа делают её ценным свидетельством народной культуры и языковых процессов в славянской ономастике.