Фамилия Дейкова чаще всего — женская форма от Дейков, и её значение проще всего понять, разобрав мужской вариант. В основе фамилии лежит прозвище Дейко. Самое прямое объяснение ведёт в украинскую речь, где «дейко» — это междометие вроде «ну, давай» или «айда». Таким прозвищем могли наградить человека бойкого, заводилу, который постоянно подбивал других на какие-то дела. Версия живая и бытовая, без громких исторических допущений.

Менее вероятный, но упоминаемый в ономастике вариант — связь с турецким словом «дей» («дай»), обозначавшим почётный чин в янычарском войске Османской империи. Это редкий и экзотичный корень для русской фамилии, и опираться на него стоит с осторожностью: такие заимствования скорее исключение, чем правило, и требуют прямых доказательств контактов предка с османской средой.

Гораздо надёжнее другая нить: прозвище Дей (или Дейко) зафиксировано в русской истории. С. Б. Веселовский в своих работах по ономастике упоминает Дея Ивана Дмитриевича Ярославского, жившего в середине XV века. От него, по преданию, пошли князья Деевы, а их родовое гнездо — село Деево Городище под Ярославлем. Это не значит, что все Дейковы — потомки князей, но показывает, что основа «Дей-» существовала в древнерусской антропонимии и была связана с вполне конкретными людьми и местами.

С точки зрения словообразования всё просто: к основе Дейко добавился типичный русский суффикс принадлежности -ов, а затем окончание -а для женского рода. Фамилия закрепилась в XV–XVI веках, когда на Руси формировалась традиция передавать родовые именования по мужской линии. Потомок человека по прозвищу Дейко получал фамилию Дейков, а его дочь или жена — Дейкова.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и украинским областям, что хорошо согласуется с украинским происхождением прозвища. Встречается она и в центральной России, куда могла попасть вместе с переселенцами.