Фамилия Дейнего образована от прозвища, указывавшего на социальное положение или род занятий человека. В XVII веке дейнегой называли украинского казака, вооружённого дубиной или кием — отсюда и меткое прозвище, которое затем закрепилось как фамилия. Царское правительство активно привлекало казачество для охраны границ и участия в войнах, поэтому прозвище было в ходу в среде запорожских и слободских казаков.

Форма фамилии — Дейнего — нестандартна для русского языка. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский. Окончание -о указывает на украинское происхождение: так оформлялись прозвища в родительном падеже с притяжательным значением («чей?» — Дейнего, то есть «сын или человек Дейнеги»). Подобная модель встречается в украинских фамилиях вроде Головко, Носенко, но здесь основа не имя, а прозвище.

Исходное слово «дейнека» (или «дейнего») имеет несколько версий происхождения. По одной, оно связано с тюркским «дейнек» — «дубина, палица», что прямо отсылает к вооружению казака. По другой, более спорной, это диалектное название неуклюжего или нерасторопного человека. Первая версия выглядит убедительнее, учитывая исторический контекст: казаки-дейнеки были известны своим боевым снаряжением.

Среди однокоренных фамилий — Дейнека, Дейнекин, Дейнеко. Все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами и региональной привязкой. Дейнего — самая редкая форма, встречающаяся преимущественно в южнорусских и украинских областях, где в XVII–XVIII веках была распространена казачья вольница.