Фамилия Доброфлотова происходит от двух корней: «добр» (от слова «добрый» - «хороший») и «флот». Вероятно, фамилия Доброфлотова является искусственной. Даже в начале XX века в военные части попадало множество молодых ребят из крестьянских семей, не имевших фамилий. Регулярный Военно-Морской Флот России был заложен на верфях Воронежского адмиралтейства. Причиной тому стал неудачный поход русской армии к турецкой крепости Азов в 1695 году. Полная блокада Азова не удалась, потому что у русских не было флота. Крепость снабжалась бойцами, провиантом и боеприпасами с моря турецким флотом. Вскоре после этого Боярская дума приняла постановление «Морским судам быть…». Зимой 1695—1696 годов были построены первые корабли и судна. Менее вероятно, что эта фамилия связана с аббревиатурой «Доброфлот», то есть «Добровольный флот» — подконтрольное правительству российское и советское морское судоходное общество, основанное на добровольные пожертвования в 1878 году. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому точно определить время и место происхождения рода Доброфлотовых можно лишь на основании серьезных генеалогических исследований.