Фамилия Долганюк образована от прозвища Долган. В основе прозвища, скорее всего, лежит прилагательное «долгий» в старом значении «большой, длинный». Долганами на Руси называли рослых, высоких людей — это самая прямая и распространённая версия. Суффикс -юк указывает на западнорусское или украинское происхождение: в этих землях он часто заменял великорусские суффиксы -ов/-ев и означал «сын» или «потомок». То есть Долганюк — буквально «сын Долгана».

Менее вероятна, но тоже возможна связь с этнонимом «долганы» — так называется один из тюркоязычных народов Сибири. Однако прозвище Долган встречается в документах задолго до того, как русские землепроходцы плотно познакомились с этим народом. К тому же этнические прозвища в крестьянской среде обычно давали не по самоназванию, а по внешним признакам: «татарин», «чухна», «калмык». Долганы же — народ малочисленный и довольно замкнутый, поэтому маловероятно, что прозвище прижилось бы в центральных или западных губерниях.

Интересно, что фамилия Долганюк почти не встречается за пределами Украины и юго-западных областей России. Это косвенно подтверждает первую версию: суффикс -юк характерен именно для Подолья, Волыни и Полесья. Если бы прозвище пришло из сибирских говоров, оно скорее оформилось бы по-великорусски — Долганов или Долганин.

В польских и белорусских метриках XVIII века изредка попадается форма Dołhaniuk — с характерным для польского написанием через ł. Это лишний раз указывает на то, что корень «долг-» здесь связан именно с длиной, ростом, а не с этнонимом. Впрочем, окончательно отбрасывать сибирскую версию не стоит: если предки носителя фамилии жили в Забайкалье или Якутии, связь с народом долган вполне реальна. Но для большинства Долганюков, чьи корни уходят на запад, объяснение через рост остаётся главным.