Фамилия Домеников — редкий случай, когда русская фамилия по форме, но явно нерусская по корню. Её основа — мужское имя Домен, которое в русском языке не встречается. Скорее всего, это народная или канцелярская адаптация итальянского имени Доменико (Domenico). В русской записи итальянские имена часто «обрубали» до удобного произносимого варианта, отбрасывая окончание. Так Доменико превращался в Домена, а от него уже по стандартной модели с суффиксом -ов образовали фамилию Домеников.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую форму: Домеников буквально значит «сын Домена» или «принадлежащий Домену». В этом смысле фамилия ничем не отличается от тысяч других на -ов, но её основа выбивается из ряда. Если бы корень был славянским, мы бы ожидали форму вроде Домников (от Домна, Домник — домашний, домовитый). Здесь же явно чувствуется западноевропейский след.

В России итальянские имена могли закрепиться у потомков иностранных мастеров, архитекторов, артистов или военных, приглашённых на службу в XVII–XIX веках. Домеников — не единственная такая фамилия: существует ряд Доменикиных, Домениковых, Доментьевых, где корень тот же, но суффиксы разные. Вариант на -ов, а не на -ин, подсказывает, что имя-основа звучало как Домен (мужской род, твёрдое окончание), а не Домена (женский род).

Географически фамилия встречается редко, но точечно — в центральных регионах России, особенно в Москве и Санкт-Петербурге, что косвенно подтверждает её «столичное» происхождение: приезжие специалисты оседали в крупных городах.

Итак, если вы Домеников, ваши предки, скорее всего, не крестьяне, а люди, связанные с профессиональной миграцией из Европы. Фамилия — не переосмысленное прозвище, а калька с личного имени, попавшая в русский быт через документы или устное общение.