Фамилия Доминикова — женская форма, а мужская — Домиников. Редкий случай, когда в основе лежит не крестильное имя, а напрямую латинское слово. Корень — «dominus», что значит «господин», «владыка». В русскую традицию это имя пришло через католическую культуру, точнее через святого Доминика, основателя ордена доминиканцев. Но в крестьянской среде, особенно на западе и юге России, где были сильны польские и литовские влияния, Домиником могли назвать и без связи с церковной иерархией — просто как звучное имя.

Модель образования типичная: от полной формы имени Доминик (а не от уменьшительной Дома или Димка) с помощью суффикса -ов. Суффикс указывает на принадлежность: «чей?» — Домиников, то есть сын Доминика. Такие фамилии обычно получали люди, чей отец носил это имя, и в XIX веке их фиксировали в метриках. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образовывались от основ на -а, -я, здесь мы видим классическую модель для мужских имён на твёрдый согласный.

Спорных версий практически нет. Иногда пытаются связать Доминикову с греческим «домик» (строение) или с диалектным «домик» (ласкательное к дом), но это натяжка: ударение в фамилии падает на третий слог (Домини́кова), а слово «домик» — на первый. К тому же суффикс -ов чётко указывает на имя, а не на бытовое прозвище. Единственная альтернатива — если фамилия произошла от прозвища Доминик, данного за важный, «господский» вид, но это менее вероятно: такие прозвища обычно давали не по латыни, а по бытовым чертам.

Географически фамилия тяготеет к регионам, где было сильно католическое влияние: Смоленская, Брянская области, западные районы Беларуси и Украины. В центральной России Доминиковы встречаются редко, чаще как случайные переселенцы. Социально — это не дворянская фамилия (дворяне брали семинарские или искусственные фамилии на -ский), а крестьянская или мещанская, зафиксированная в поздних ревизских сказках.

Если сравнивать с однокоренными, то Домиников — более редкая форма, чем, скажем, Домников (от сокращённого Домник) или Доминов (от прозвища Домна). Но именно полное имя Доминик сохраняет в фамилии отчётливую связь с латинским корнем, что делает её необычной для русского ономастикона.