Фамилия Дондя звучит не по-русски, и это верная зацепка. В ней нет типичных русских фамильных суффиксов (-ов, -ев, -ин, -ский), а окончание -я указывает скорее на украинское или белорусское происхождение. В таких языках суффикс -я часто превращает прозвище в фамилию без дополнительных наращений: Дондя — это и есть исходное прозвище, застывшее в роли фамилии.

Корень «донд-» в восточнославянских говорах неочевиден. Скорее всего, он восходит к диалектному слову «донда» или «дондя», которое могло означать вялого, медлительного человека или, наоборот, кого-то с необычной походкой. Есть и другая версия: в украинских говорах «донда» — это вид корзины или плетёной ёмкости, так что прозвище могло закрепиться за корзинщиком или торговцем такой утварью. Третья возможность — фамилия тюркского происхождения, от слова «дон» (одежда, шуба) с уменьшительным аффиксом, но это менее вероятно, так как ареал фамилии прослеживается именно в западных регионах бывшей Речи Посполитой.

Географически фамилия Дондя встречается в основном на западе Украины — в Тернопольской, Хмельницкой, Львовской областях, а также в юго-восточной Польше (историческая Галиция). В России она редка и, скорее всего, принесена переселенцами из тех краёв. Сословно носители были, вероятнее всего, крестьянами или мещанами — дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Интересно, что фамилия Дондя стоит в одном ряду с однокоренными Донда, Дондук, Дондик — все они образованы по одной модели (основа + -я/-ик/-ук) и указывают на прозвищное происхождение. Сравните с украинскими фамилиями Непийпиво, Вернигора — та же структура «чистого прозвища» без суффикса принадлежности. Так что предок носителя фамилии Дондя, скорее всего, получил её за характерную черту или занятие, заметное окружающим.