Фамилия Дондин звучит как типичная «географическая», но на деле её корень может быть не таким очевидным. Первое, что приходит в голову — связь с рекой Дон. Однако в русской ономастике фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а или -я (Доня, Донда), а не от названия «Дон» (от него пошла бы фамилия Донов). Поэтому искать предка-казака или жителя Придонья напрямую не стоит.

Главный претендент на основу — прозвище или мирское имя Донда. В русских говорах слово «донда» или «дондя» имело несколько значений: так могли назвать медлительного, вялого человека (от глагола «дондеть» — ныть, тянуть), либо, наоборот, болтуна и пустомелю. В псковских и тверских говорах «донда» — это ещё и вид брани, нечто вроде «простофиля» или «разиня». Человек с таким прозвищем явно выделялся характером, и фамилия закрепилась за его потомками.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Дондин, то есть сын или потомок Донды. Эта модель — одна из древнейших в русской антропонимии, она характерна для северных и центральных областей России, где фамилии часто образовывались от прозвищ, а не от официальных имён.

Есть и более редкая, но вполне реальная версия: фамилия могла возникнуть от имени Донат (от латинского donatus — «дарованный»). В народной речи это имя часто сокращали до Доня, Донда, а от уменьшительной формы по тому же принципу появился Дондин. Такой путь типичен для фамилий, которые на слух кажутся «речными», а на деле оказываются крестьянскими или мещанскими по происхождению.

Стоит учесть и вариант, что фамилия могла быть связана с этнонимом «дондин» — так на Урале и в Сибири иногда называли коми-пермяков и других финно-угров (от диалектного «донда» — «чужак, инородец»). Это локальная, но возможная версия для семей, вышедших из Прикамья. В любом случае, Дондин — фамилия не аристократическая, а народная, и её носителю стоит искать корни не на карте, а в старых переписных книгах северных или волжских губерний.