Фамилия Дондова — женская форма мужской фамилии Дондов. Её основа — личное имя, прозвище или этноним, а суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей-то потомок», «из семьи такого-то». В русской традиции такие фамилии закрепились в XVI–XVII веках, когда крестьян и посадских людей начали массово записывать по отцу или деду.

Корень «донд-» — редкий для центральной России. Скорее всего, он восходит к тюркским или монгольским языкам, где «донд» (или «дондо») значит «теленок» или «молодое животное». В бурятском и калмыцком имя Дондок (уменьшительное Дондо) не редкость: его давали мальчикам, чтобы подчеркнуть крепость и здоровье. От этого имени и пошла фамилия Дондов (а затем Дондова). Если предок был бурятом или калмыком, фамилия могла возникнуть при переходе на русскую модель фамилеобразования в XIX веке.

Другая версия — географическая. В Забайкалье и Бурятии есть река Донда, а также несколько урочищ с похожим названием. Жителей этих мест могли прозвать Дондовыми, то есть «с Донды». В этом случае фамилия указывает не на личное имя, а на место выхода семьи.

Встречается фамилия и у русских старообрядцев Восточной Сибири. Там «донда» могло быть диалектным прозвищем — так называли медлительного, спокойного человека. Но эта версия менее убедительна, так как слово не зафиксировано в основных словарях русских говоров.

Независимо от происхождения, фамилия Дондова остаётся локальной: её носители живут в основном в Бурятии, Иркутской области и Забайкальском крае. За пределами этих регионов она встречается редко.