Прозвище Дондук, от которого образована фамилия Дондукова, связано с диалектным словом «дундук». В олонецких и смоленских говорах так называли бестолкового человека, а также толстого мужчину маленького роста. Эта региональная привязка — ключ к пониманию фамилии: она не общерусская, а характерна для северных и западных областей России. Суффикс -ов- указывает на модель образования от мужского прозвища, типичную для русских фамилий: Дондук → Дондуков → Дондукова.

В отличие от большинства фамилий на -ов, где основа ясна без словарей, здесь корень «дундук» сам по себе редкий и имеет чёткую диалектную окраску. Это значит, что предок носительницы фамилии жил в среде, где такое прозвище было понятно и употребительно — вероятно, в крестьянской или посадской среде Олонецкой или Смоленской губерний. Прозвище могло закрепиться за человеком не столько за глупость, сколько за внешность: в говорах «дундук» нередко означало «коренастый, плотный», без отрицательной оценки. Со временем это бытовое прозвище перешло в фамилию, передавшись потомкам как родовое имя.