Фамилия Дорофеенкова — женская форма от Дорофеенков, а та, в свою очередь, образована от мужского имени Дорофей. Имя это греческое, составленное из слов «дорон» (дар) и «теос» (бог), то есть «дар Божий». В святцах имя встречается часто, поэтому в старину оно было распространено на Руси среди всех сословий.

Разберём модель. Основа — имя Дорофей. Далее идёт редкий и очень показательный суффикс «-енк(ов)». В русской ономастике суффикс «-енко» типичен для украинской и южнорусской традиции: он означает «маленький», «сын» или «потомок» (Дорофеенко — сын Дорофея). Но фамилия заканчивается на «-ов», что характерно для великорусских фамилий. Перед нами гибридная модель: украинский патронимический суффикс «-енк-» оброс русским фамильным суффиксом «-ов». Это говорит о том, что носитель фамилии (или его предок) попал в среду, где фамилии оформляли по московскому образцу, но исходное прозвище или отчество сохранило южнорусскую форму.

Вероятнее всего, предок носителя фамилии происходил с территории современной Украины или южных областей России (Курская, Белгородская, Воронежская губернии), откуда переселился севернее. Там его отчество Дорофеенко («Дорофеев сын») закрепилось как фамилия, а затем, при записи в ревизские сказки, получило окончание «-ов» по аналогии с местными фамилиями. Вариант Дорофеенков — мужская форма, а Дорофеенкова — соответственно, женская, по правилам русского языка.

Встречается фамилия и в форме Дорофейченков, Дорофеев — все они восходят к тому же имени, но Дорофеенкова выделяется именно этим двойным суффиксом, указывающим на миграцию и смену культурного контекста. Никаких сведений о дворянском происхождении или принадлежности к известным родам нет: это рядовая фамилия, возникшая в крестьянской или мещанской среде в XVIII–XIX веках.