Фамилия Дойниченко звучит на украинский лад и сразу указывает на своё происхождение: перед нами типичная фамилия, образованная по южнорусской и украинской модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в XVI–XVIII веках в Поднепровье и Слобожанщине означал «сын» или «потомок», то есть Дойниченко — буквально «сын Дойника» или «маленький Дойник». Основа фамилии — прозвище Дойник, которое, в свою очередь, происходит от глагола «доить» или существительного «дойник» — так называли человека, который доит коров, или, в более широком смысле, скотника, пастуха дойного стада. В украинских говорах слово «дойник» могло также относиться к сосуду для молока — подойнику, но прозвище, скорее всего, давали именно по занятию: предок носителя фамилии был дояром или хозяином молочного скота.

Словообразовательная цепочка прозрачна: от основы дой- (корень, связанный с доением) через суффикс -ник образуется название профессии или орудия, а затем с помощью патронимического -енко — фамилия. В отличие от великорусских фамилий на -ов/-ев (Дойников), которые фиксируют принадлежность «чей?», украинская модель на -енко подчёркивает родство «чей сын?». Поэтому Дойниченко — фамилия не столько вотчинная или помещичья, сколько крестьянская, казацкая или мещанская, распространённая среди свободного сельского населения.

Географически фамилия тяготеет к Центральной и Восточной Украине, а также к южным областям России, куда в XVIII–XIX веках переселялись украинские крестьяне и казаки. Встречаются варианты написания Дойниченко и Дойниченко (с ударением на второй или третий слог), но они не меняют ни корня, ни значения. Если сравнить с однокоренными фамилиями — Дойников, Дойниченков (гибридная форма, русифицированная уже на русской почве), Дойнич (белорусский вариант), — то Дойниченко остаётся наиболее «чистым» украинским патронимом, не тронутым московской переделкой.

Известных исторических личностей с этой фамилией в открытых источниках не зафиксировано, что типично для прозвищных фамилий, возникших в среде рядовых казаков и крестьян. Это не фамилия дворянского рода, а имя, которое давали по ремеслу, и оно говорит о том, что предок носителя был тесно связан с молочным хозяйством — занятием повседневным, но важным для любого села.