Фамилия Дубаткова — женская форма, а её мужской вариант Дубатков. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Дубаток. Словообразовательная модель проста: суффикс -ок- (уменьшительно-ласкательный или указывающий на носителя признака) плюс типичный русский фамильный суффикс -ов-. Фамилии на -ов/-ев — самые распространённые в России, но здесь интересна именно основа.

Корень «дуб» в русских фамилиях встречается часто: Дубов, Дубинин, Дубровский. Однако Дубатков стоит особняком. Скорее всего, исходное прозвище Дубаток дали человеку крепкому, сильному, упрямому — «как дуб». В народной речи слово «дубаток» могло означать не только молодой дубок, но и крепыша, здоровяка. В некоторых говорах «дубатком» называли тяжёлый дубовый молот или колотушку — отсюда могло пойти прозвище мастера, работавшего с деревом, или просто человека с тяжёлой рукой.

В ономастических исследованиях фамилия Дубатков практически не описана, что говорит о её относительной редкости. По географии бытования она встречается в центральных и южных областях России, особенно в Рязанской, Тамбовской и Воронежской областях — в зоне распространения дубрав. Встречаются также варианты написания через «о»: Добатков, но это уже иная этимология, связанная с глаголом «добать» (добывать).

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Дубатков — не от географического названия (как Дубовский), а именно от прозвища, что типично для крестьянской среды. Фамилия могла закрепиться за родом в XVI–XVII веках, когда в России активно шёл процесс оформления фамилий у тяглового населения. Социальный контекст: предки Дубатковых, скорее всего, были не дворянами, а крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по личной характеристике родоначальника.