Фамилия Дубко образована от аналогичного прозвища, в основе которого лежит нарицательное «дуб». Например, в смоленских говорах прозвище Дубень означало «честный, непоколебимый человек». Не исключено, что фамилию Дубко получил мастер, занимавшийся дублением кож. Это были притяжательные прилагательные с суффиксами –ук /-юк, -енко, -ко изначально указывающие на прозвище отца.