Фамилия Дуборко встречается нечасто, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза — суффикс -ко, который в украинской и белорусской ономастике указывает на уменьшительно-ласкательную или патронимическую форму. В этом регионе фамилии на -ко (Ковалько, Гринько, Шевченко) буквально означают «маленький» или «сын такого-то». Значит, основу Дубор- нужно искать в прозвище или имени.

Самый вероятный корень — «дуб». В славянской традиции дуб символизировал силу, крепость и долголетие. Прозвище Дуб или Дубок давали рослому, физически мощному человеку или же упрямому, «крепкому» характером. Форма Дуборко могла возникнуть как вариант: от прозвища Дубарь (человек, работающий с дубом, например, заготовщик коры для дубления кож) с последующим смягчением и добавлением суффикса. Тогда Дуборко — это «сын Дубара» или «маленький Дубарь». Менее вероятна, но возможна связь с топонимом: на Украине и в Беларуси встречаются села с названиями вроде Дубровка, Дубовое, и фамилия могла закрепиться за выходцем оттуда.

Географически фамилия тяготеет к юго-западным областям. В дореволюционных метрических книгах Дуборко чаще всего фиксировали в Черниговской, Киевской и Могилёвской губерниях — на стыке украинского и белорусского диалектов. Это объясняет и суффикс, и мягкую «р» в корне (в отличие от более северного «Дубов» или «Дубинин»). Сословно носители фамилии были преимущественно крестьянами или мещанами, что типично для прозвищных фамилий, не связанных с дворянскими родами.

Есть и спорная версия, которую иногда выдвигают: связь с личным именем Добрыня (через чередование б/в и перестановку). Но она слабая — фонетически «Дуборко» далеко от «Добрыни», и нет письменных свидетельств такой трансформации. Гораздо правдоподобнее, что перед нами прозвище, закрепившееся за родом «крепких дубом» людей — либо по внешности, либо по ремеслу.