Фамилия Дудалин — одна из тех, чья основа лежит не в крестильном имени, а в прозвище или названии ремесла. В её центре — слово «дуда», то есть дудка, музыкальный инструмент. Человек, получивший прозвище Дудала или Дудаль, мог быть музыкантом-дударём, пастухом, игравшим на дудке, или просто любителем посвистеть и напевать. В говорах слово «дуда» имело и переносное значение — болтун, пустомеля, так что прозвище могло закрепиться за говорливым человеком.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Дудалин — сын или потомок Дудалы. В русской антропонимии модель на «-ин» характерна для основ, оканчивающихся на «-а» или «-я», что полностью совпадает с формой прозвища Дудала. Эта модель продуктивна в северных и центральных регионах России, где фамилия Дудалин встречается чаще всего, особенно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с тюркским корнем «дуда» — «друг, товарищ». Однако для русского ономастикона это редкий случай, и без документальных подтверждений конкретной тюркской миграции такая гипотеза уступает «музыкальной». В пользу исконно русского происхождения говорит и наличие однокоренных фамилий: Дудин, Дудкин, Дударев, Дудников. Все они образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что типично для русской модели гнездового словообразования.

Фамилия Дудалин не принадлежала к дворянским или купеческим родам — её носителями в основном были крестьяне и ремесленники. В документах XVII–XVIII веков встречаются упоминания крестьян Дудалиных на Севере, в частности в Сольвычегодском уезде. Таким образом, предки современных Дудалиных с высокой вероятностью были людьми, чья жизнь была связана с пастушеством, музыкой или просто с яркой речевой характеристикой, закрепившейся в прозвище.