Фамилия Дуньков образована от прозвища Дунько. Предположительно, оно ведет свое начало от нарицательного «дунька» - так на Украине и на юге России называли дыню. Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Дунько относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог заниматься выращиванием или продажей дынь. Согласно другой гипотезе, в основе фамилии Дуньков лежит имя Дунько, производная форма женского крестильного имени Евдокия, которое в переводе с древнегреческого означает «благоволение». Так и прозвище Дунько закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Дуньков. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Дунько, со временем получил фамилию Дуньков.