Основой фамилии Дурнайкин послужило мирское имя Дурнайка. Мирское имя Дурнайка образовано от прилагательного «дурной» со значением «некрасивый, глупый». Имена с основой -дур- (Дурень, Дурак, Дурной) были довольно распространены на Руси и не считались оскорбительными. Они относились к числу «охранительных» именований, выполняющих функцию оберега. В данном случае, надеясь иметь здорового, доброго, умного и красивого ребенка со счастливой судьбой, родители назвали его Дурнайкой. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Дурнайка, со временем получил фамилию Дурнайкин. Так, например, в Книге памяти Нижегородской области упоминается Сергей Андреевич Дурнайкин, родившийся в 1912 году.