Фамилия Дуткин образована от прозвища Дутка. Скорее всего, в его основе лежит прилагательное «дутый». В разных русских говорах у этого слова был целый веер значений: «полный, толстый», «надутый, сердитый», а также «пустой, вздорный». Значит, Дуткой могли прозвать человека за полноту, обидчивость или болтливость. В чистопольских и волынских говорах «дутым» называли гордого человека — это ещё одна возможная характеристика.

Подобные именования встречаются в документах с XVI века. Например, в 1552 году упоминается Иван Дутый, винницкий мещанин, а в 1548 году — Ивашко Дутка, литовский мужик из Красногородского уезда. Фамилия строится по стандартной модели: к основе Дутк- добавляется суффикс -ин, который в русской традиции указывает на принадлежность («чей?» — сын Дутки). Так что прямой ответ на вопрос о происхождении — фамилия указывает на потомка человека по прозвищу Дутка.

Есть и другая, менее распространённая версия. Она связывает фамилию Дуткин с эвенским родовым именем Дутки. В этом случае фамилия могла возникнуть не из прозвища, а из этнического или родового названия, которое со временем оформилось по русской модели с суффиксом -ин. Однако, учитывая ранние фиксации «Дутки» в западных русских землях, прозвищное происхождение выглядит более правдоподобным для большинства носителей фамилии.