Фамилия Дуткина образована от прозвища Дутка — это не имя, а уличное или профессиональное прозвище. В его основе лежит слово «дуда» или «дудка» (духовой музыкальный инструмент). Игра на дудке была традиционным занятием пастухов: с помощью инструмента они собирали стадо и подавали сигналы. Поэтому прозвище Дутка чаще всего давали именно пастуху, реже — музыканту-дударю.

Слово «дудка» в русских говорах звучало и как «дутка» (с твёрдым [т]). Замена «д» на «т» в прозвище — результат исторических фонетических изменений, характерных для ряда восточнославянских диалектов. Именно форма Дутка, а не Дудка, закрепилась как основа фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Дуткина — «дочь (или жена) Дутки». В русской антропонимии фамилии на -ин обычно образовывались от основ на -а/-я, в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые шли от основ на согласный. Так что с точки зрения словообразования фамилия Дуткина полностью укладывается в классическую модель: прозвище Дутка → фамилия Дуткин → женская форма Дуткина.

Других правдоподобных версий происхождения у этой фамилии нет: связь с глаголом «дуть» (через значение «надутый, толстый») маловероятна, так как в таком случае ожидалась бы форма Дутин или Дутьев. Слово «дутка» в значении «трубка, дудочка» — прямое и прозрачное, поэтому именно музыкально-пастушеская версия остаётся основной.

Фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, что косвенно подтверждает её связь с пастушеским промыслом, распространённым в этих местах.