Фамилия Дындюк почти наверняка украинская по происхождению. На это указывает характерный суффикс -юк, который в украинской ономастике играет ту же роль, что русские -ов и -ин: он образует фамилии от личных имён и прозвищ, буквально означая «маленький» или «потомок» (Дындюк — «сын Дынды»).

Куда сложнее с корнем. Основа Дынд- в украинском языке не является ни распространённым именем, ни очевидным ремесленным термином. Скорее всего, в её основе лежит прозвище. Самая вероятная версия связывает её с диалектным словом «динда» или «дында». В некоторых говорах Украины и юга России так называли человека неуклюжего, медлительного, с тяжёлой походкой — этакого увальня. Слово звукоподражательное, имитирующее тяжёлые шаги или топот (сравните с русским «дын-дын» о колоколе, но здесь скорее о глухом звуке). Прозвище Дында закреплялось за человеком по характерной манере ходить или по грузной фигуре, а уже его дети получали фамилию Дындюк.

Менее убедительна, но возможна версия от тюркских корней, где «дын» (dın) может означать «вера», «религия». Однако в таком случае форма Дындюк была бы нетипичной, и для украинской среды эта гипотеза выглядит натянутой.

Географически фамилия Дындюк распространена в основном на западе Украины, особенно в Тернопольской и Хмельницкой областях, а также среди украинской диаспоры. Это довольно редкая фамилия, что подтверждает её происхождение от локального, а не общеупотребительного прозвища. Сословно её носители, скорее всего, были крестьянами или казаками, так как суффикс -юк в массе своей закрепился именно в этих средах, в отличие от шляхетских фамилий на -ский. Таким образом, Дындюк — это «сын того, кого дразнили Дындой», и прозвище это, скорее всего, описывало внешность или походку.