Фамилия Дюндюк — яркий пример прозвища, данного по внешности или характеру. В её основе лежат диалектные слова, которые в разных регионах звучали по-своему, но сходились в значении: человек невысокого роста или, по другой версии, бестолковый.

В олонецких говорах бытовало слово «дундук» — так называли толстого мужчину маленького роста. А в смоленских говорах существовало слово «дюндик» — «коротыш, малорослый человек». Фамилия могла закрепить именно этот оттенок: предок был невысоким, коренастым. Но есть и другая версия: от того же «дундука» в значении «бестолковый». Прозвище могло даваться с иронией или как оберег — родители нарекали ребёнка Дюндюком, надеясь, что он вырастет высоким и статным, наперекор прозвищу.

Словообразовательная модель проста: суффикс -юк характерен для украинских и южнорусских фамилий, он указывает на носителя признака (ср. «коротыш» — «коротышка»). То есть Дюндюк — это буквально «человек, которого прозвали Дюндя» (от «дюндик»). Фамилия редкая, географически привязана к западнорусским и украинским землям, где такие говоры были распространены.

Сословной принадлежности предков точно определить нельзя: прозвищные фамилии на -юк встречались и у крестьян, и у казаков. В официальных документах фамилия фиксируется поздно, в XIX веке, когда прозвище уже закрепилось за родом. Споров среди ономастов нет: версия с «коротышом» считается основной, значение «бестолковый» — второстепенным, поскольку в прозвищах внешность фиксируется чаще, чем умственные качества.