Фамилия Дюдин образована от прозвища Дюндя. По одной из версий, это прозвище ведет свое начало от диалектного слова «дундук», которое имеет значение «бестолковый человек». В олонецких говорах это существительное употреблялось также по отношению к толстому мужчине маленького роста. Также возможно, что это прозвище ведет свое начало от слова «дюндик», которое в смоленских говорах означало «коротыш, малорослый человек». Соответственно, прозвище Дюндя указывало на особенности внешности основателя фамилии. Не исключено, что прозвище Дюндя выполняло так называемую «охранительную» функцию и использовалось в качестве оберега. В данном случае, надеясь иметь высокого, статного, умного мальчика, родители могли называть его Дюндей. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Дюндя, со временем получил фамилию Дюндин.