Фамилия Джанчотова — редкий пример фамилии, образованной от имени с ярко выраженной региональной и этнической привязкой. Её основа, скорее всего, восходит к тюркскому или кавказскому личному имени Джанчот (варианты: Джанчота, Джанчото). Корень «джан» в тюркских языках означает «душа», «жизнь», часто используется как ласковое обращение или часть составных имён. Вторая часть — «чот» — может быть связана с числом «сто» (йөз/юз) или с глагольной формой, но в данном контексте правдоподобнее видеть в ней усечённый компонент имени Чот (Чота) — краткой формы от имён вроде Чотча или Чотбай, распространённых у карачаевцев, балкарцев и ногайцев. Таким образом, Джанчот могло значить «дорогой, как сто душ» или «любимый Чот».

Суффикс -ов- указывает на русскую модель оформления фамилии: к основе Джанчот добавили патронимический суффикс, характерный для фамилий, которые в XIX–XX веках фиксировались в метриках и документах на русском языке. Окончание -а — женский вариант фамилии, то есть Джанчотова — это форма для женщины, а мужская — Джанчотов. Такая фамилия почти наверняка принадлежит к числу тех, что возникли в среде горских народов Северного Кавказа, где в советский период активно русифицировали фамилии, добавляя типовые русские окончания.

Географически фамилия Джанчотов/Джанчотова встречается преимущественно в Карачаево-Черкесии, Кабардино-Балкарии и среди карачаево-балкарской диаспоры. Это не случайно: составные имена с компонентом «джан» типичны именно для этой языковой группы. В отличие от многих фамилий, которые можно встретить по всей России, Джанчотова остаётся локальной, что делает её надёжным маркером происхождения из указанного региона.

По сословной принадлежности предки носителей фамилии, скорее всего, относились к свободным общинникам или узденям — то есть к основной массе горского населения, не имевшей княжеского титула, но и не бывшей в крепостной зависимости. Ремесленная или профессиональная привязка здесь не прослеживается: фамилия образована от личного имени, а не от занятия. Интересная деталь: в некоторых записях XIX века встречается написание «Джан-Чотов» через дефис, что подчёркивает составной характер имени-основы и указывает на то, что в момент фиксации фамилия ещё не устоялась в единой орфографии.