Фамилия Джумахонов несёт в себе отчётливый тюркский след, и её разумнее всего разбирать, отталкиваясь от азиатского корня и русского суффикса. Основа «Джумахон» — это сложное имя, популярное у узбеков, таджиков и других народов Центральной Азии. Первая часть «Джума» (вариант «Жума») означает пятницу — священный день у мусульман, день коллективной молитвы. Вторая часть «хон» (хан) — древний титул правителя или владыки, но в именах он часто выступал как почтительная частица, пожелание величия и знатности. Таким образом, имя Джумахон буквально переводится как «владыка пятницы» или «рождённый в пятницу господин».

Русский суффикс «-ов» превратил это восточное имя в фамилию по стандартной модели, принятой в Российской империи. Когда народы Средней Азии вошли в состав государства, их имена начали русифицировать для документов: Джумахон превращался в Джумахонова (для женщины) и Джумахонова (для сына). Фамилия Джумахонов означает «принадлежащий к роду Джумахона», «сын Джумахона».

Интересная деталь: ударение в фамилии обычно падает на последний слог — ДжумахонОв, хотя в исходном имени ударным был предпоследний слог (ДжумахОн). Такое смещение типично для фамилий, образованных от восточных имён через русский патронимический суффикс.

Встречается фамилия преимущественно в Узбекистане, Таджикистане, а также среди выходцев из этих регионов в России, Казахстане и Кыргызстане. В дореволюционных метрических книгах её почти нет — массово фамилии у оседлого населения Туркестана закрепились только в советское время, в 1920–1930-е годы, при паспортизации. Тогда же появился и вариант Джумаханов (с буквой «а» в середине), но Джумахонов — более точная передача исходного имени.

Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были ремесленниками, торговцами или земледельцами из оазисов Ферганской долины или Самарканда. Имя Джумахон давали не только знати — в народной среде оно было пожеланием достатка и уважения, как и многие имена с компонентом «хон».