Фамилия Ефаров образована от личного имени, и здесь есть две основные версии. Первая и наиболее вероятная связывает её с редким крестильным именем Евферий. В переводе с древнегреческого оно означает «удачливый на охоте». В повседневной речи полное имя сократили до просторечной формы Ефар — так же, как Евстафий превращался в Остап, а Иоанн в Иван. Именно от этой производной формы и появилась фамилия: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть буквально «сын Ефара».

Вторая гипотеза предполагает тюркское происхождение основы. Согласно ей, имя Ефар могло быть диалектным вариантом мужского имени Джагфар (в арабском языке — «ручей», «родник», «речушка»). В русской среде оно преобразовалось в Яфар, а затем и в Ефар. Такое смешение имён не редкость для регионов, где русское и тюркское население веками жило рядом.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе (Ефар) прибавили патронимический суффикс -ов. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был человеком незнатного происхождения — крестьянином, посадским или служилым, поскольку дворянские фамилии часто оформлялись суффиксами -ский/-ской. Географически фамилия встречается в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает обе версии: и греческое имя через церковные святцы, и тюркское — через соседство с народами, исповедующими ислам.