Фамилия Ельфимов происходит от мужского крестильного имени Ефимий (в церковной форме — Евфимий), которое с греческого переводится как «благочестивый» или «священный». В основу фамилии легла просторечная, народная форма этого имени — Ельфим. Подобные искажения были обычны для русской бытовой речи: так, каноническое Евфимий в разговорном языке превращалось в Ефим, Офим, а в некоторых говорах — в Ельфим с характерным «л» на стыке звуков.

Одним из небесных покровителей имени считается Евфимий Великий (376–477), известный также как Евфимий Благодушный. Он с юности был посвящен в пресвитеры, управлял монастырями в Мелитине, а позже сам жил в пустыни, служа образцом для аскетов. Во время голода он раздавал хлеб народу — эта деталь из жития показывает, почему имя было популярно среди простых людей, которые искали заступничества и помощи.

Фамилия образована по стандартной русской модели — прибавлением суффикса -ов к основе Ельфим. Это типичный патроним (отчество, ставшее фамилией): Ельфимов буквально означает «сын Ельфима». Встречаются и однокоренные фамилии — Ефимов, Ефимцев, Офимов, — но Ельфимов стоит особняком благодаря сохранению редкой диалектной формы имени.

Географически фамилия редкая, её очаги чаще всего фиксируются в северных и центральных областях России — там, где в говорах сохранялся вставной «л» (сравните: «ольха» вместо «оха»). В документах XVII–XVIII веков можно встретить крестьян и посадских людей с именем Ельфимко — это подтверждает, что фамилия не была дворянской или сословно привилегированной, а возникла в среде крестьян и мещан.

Таким образом, носитель фамилии Ельфимов может считать своим предком человека, которого в быту звали не Ефим, а именно Ельфим, — и это имя, несмотря на кажущуюся необычность, имеет глубокую церковную основу и долгую историю в русском ономастиконе.