Фамилия Елганов — редкий случай, когда происхождение, скорее всего, не в личном имени или прозвище, а в географическом названии. Основа фамилии — топоним Елган, название села в Глазовском уезде бывшей Удмуртии. Такая модель образования (название села + суффикс -ов) типична для фамилий, которые давали крестьянам при переписях по месту жительства: переселившись в другое место, человек становился «Елгановым», то есть выходцем из Елгана.

Значение самого топонима спорное и уходит в финно-угорские языки. Наиболее вероятная версия связывает его со словом «elgata», которое переводится как «отвращать, приедаться». Если это так, то название села могло быть ироничным или «обережным» — неблагозвучное имя для места, чтобы отвадить злых духов. Реже проводят параллели с литовской основой «elg», от которой образовано название города Елгава; в этом контексте «elg» означает «беднота, нищета», что тоже могло стать нелестной характеристикой местности.

Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию иноязычной основы. Фамилия не получила широкого распространения за пределами Вятского региона и Удмуртии, что подтверждает её локальный, «гнездовой» характер. Встречаются варианты написания с одной «н» (Елганов) и с двумя (Елганнов), но исторически верным считается первый, соответствующий исходному названию села.

Таким образом, Елгановы — это потомки крестьян или служилых людей, чьи предки жили в удмуртском селе с неласковым, но метким названием.