Фамилия Елисенков прошла долгий путь, прежде чем приобрела современное звучание. Её основа — крестильное имя Елисей, которое пришло на Русь вместе с христианством. В переводе с древнееврейского оно означает «спасенный Богом», а небесным покровителем имени считается библейский пророк Елисей.

Ключевая особенность фамилии — её двойная словообразовательная модель. Первоначально она возникла на территории современной Украины или Белоруссии с типичным для этих земель суффиксом -енко, который указывал на потомка: Елисенко — «сын Елисея». Затем, когда носители фамилии переселились в великорусские земли, произошла русификация: к основе Елисенко добавили русский патронимический суффикс -ов. Так сложилась форма Елисенков, которая закрепилась в документах.

Такая двойная «приставка» встречается нечасто. Обычно фамилии на -енко при переходе в русскую среду либо оставались без изменений, либо адаптировались через суффикс -ин (Елисенкин). Вариант с -ов говорит о том, что адаптация происходила уже в официальной среде, возможно, при записи в ревизские сказки или метрические книги.

О точном времени и месте возникновения фамилии судить сложно — процесс формирования фамилий у крестьян и мещан растянулся на несколько столетий и завершился лишь к концу XIX века. Однако ясно, что родоначальник Елисенковых носил имя Елисей, а его прямые потомки сначала звались Елисенко, а затем, уже в России, окончательно закрепились как Елисенковы. Фамилия сохранила память и о древнем библейском имени, и о миграционных процессах внутри славянского мира.