Фамилия Епишков — один из примеров, где внешне простая форма скрывает неочевидную основу. На первый взгляд, суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования от мужского имени или прозвища, но с корнем «Епиш-» не всё так прямолинейно.

Скорее всего, в основе лежит неканоническая, народная форма крестильного имени Ипатий. В русской традиции это имя, пришедшее из греческого («высочайший»), давало множество производных: Ипат, Патя, а на северных и вологодских землях — Епиш, Епишка. Усечение первого слога и замена «п» на «ф» (Епифан, Опифаний) тоже были в ходу, но для Епишкова логичнее предположить именно вариант Ипатия. Таким образом, Епишков — потомок человека, которого в быту звали Епиш.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с именем Епифан (от греч. «явленный»). Его уменьшительные формы — Епиша, Епишка — дали фамилии Епишин, Епифанов, и Епишков мог возникнуть по тому же принципу, но с другим суффиксальным оформлением. Однако имя Ипатий в народной среде давало больше простора для переделок, поэтому версия с Ипатием выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России. Встречается в Вологодской, Кировской, Нижегородской областях — как раз там, где имя Ипатий было особенно распространено и давало жизнь таким фамилиям, как Ипатов, Патин, Епишев. Епишков — более редкий вариант, который мог закрепиться в одном конкретном роду, избежав унификации в форму на -ин или -ев.

Социальный контекст типичен: носитель фамилии — вероятно, крестьянин или посадский человек, чьё прозвище или мирское имя перешло в наследственное фамильное прозвание уже в XVII–XVIII веках. Дворянских корней у этой фамилии не прослеживается.