Фамилия Ердакова — женская форма, образованная от мужской Ердаков. В основе лежит прозвище Ердак. Его происхождение ономасты связывают с древнерусским словом «ердань» — так называли прорубь во льду, в которой совершали обряд водоосвящения на праздник Богоявления. Само слово «ердань» — искажённое народное переосмысление названия реки Иордан, той самой, где, по Евангелию, крестился Иисус Христос.

На иврите эта река называется Ярденит. Сегодня место на севере Израиля, у впадения Иордана в Тивериадское озеро, — популярное место паломничества: тысячи верующих приезжают туда, чтобы совершить обряд крещения. Вряд ли простой человек в Древней Руси мог добраться до Святой земли, поэтому прозвище Ердак чаще давали тому, кто крестился в крещенской проруби, либо тому, кто как-то иначе был связан с обрядом освящения воды. Встречается и другая версия: Ердаком могли прозвать человека, который ездил на богомолье к реке Иордан.

Фамилия образована по типичной модели: к основе Ердак- прибавлен суффикс -ов, указывающий на принадлежность («сын Ердака»). Поскольку в русской традиции фамилии закреплялись по мужской линии, женская форма Ердакова означает, что носительница — дочь, жена или вдова Ердакова. Фамилия редкая, её можно встретить в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её русское происхождение, без тюркских или финно-угорских корней.