Фамилия Ергунов — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская, но при этом оформлена по русской модели с фамильным суффиксом -ов. Если отбросить окончание, остаётся корень «Ергун». Это слово могло попасть в русский язык из тюркских наречий, где «ер» означает «земля» или «мужчина», а «гун» — «день» или суффикс, образующий имя. Самая вероятная версия: Ергун — это личное прозвище или имя, которое давали человеку, связанному с землёй, либо просто мужчине, которого называли «земным», «крепким».

В русской ономастике фамилии на -унов часто происходят от прозвищ, оканчивающихся на -ун (крикун, бегун). Здесь же основа «Ергун», а не «Ергу́н», поэтому ударение, скорее всего, падает на второй слог: Ергуно́в. Такая модель характерна для фамилий, образованных от имён или прозвищ на -ун, но в данном случае «ер» не является русским корнем. Встречается версия, что фамилия связана с диалектным словом «ерга» — так в некоторых говорах называли бродягу или непоседу, но это менее убедительно, так как суффикс «-ун» в таком случае дал бы форму «Ергунов» от «ергун», а не от «ерга».

Географически фамилия встречается в основном в центральной России и Поволжье — регионах, где исторически шло активное взаимодействие с тюркскими народами. Это косвенно подтверждает тюркскую версию происхождения. Предок-носитель фамилии мог быть либо обрусевшим татарином, либо русским, получившим прозвище от тюркского слова, что в XVI–XVII веках было обычным делом.

Сравните с однокоренными фамилиями: Ергунов, Ергушев, Ергаков. Все они редки и не имеют массового распространения, что говорит о локальном, а не общерусском происхождении. Если у вас фамилия Ергунов, ваш предок, скорее всего, жил на границе культур и носил прозвище, которое означало «земляной» или «крепкий как земля». Другие версии, например от греческого «эргон» (работа), выглядят натянутыми и не подкреплены данными.