Фамилия Ермоченков — это отчество второго порядка, то есть она указывает на внука человека по имени Ермоша. Строится она по цепочке: Ермоша → его сын Ермоченко → и уже его сын, то есть внук Ермоши, получил фамилию Ермоченков. Суффикс -енк- в основе характерен для украинской и южнорусской традиции образования отчеств, а конечный -ов добавился при адаптации фамилии в великорусской среде.

Само имя Ермоша — это уменьшительная форма целого ряда крестильных имён. Среди них: Ермолай (от греческого — «вестник народа»), Герман (от латинского — «родной, единоутробный»), Ермий (от греческого — «принадлежащий Гермесу», богу-вестнику и покровителю красноречия), Ермил («из гермесовой рощи»), Гермоген («из рода Гермеса») и Иеремия (от древнееврейского — «возвышенный Богом»). Выбрать одно-единственное имя-источник для конкретной семьи сегодня невозможно, но чаще всего в основе подобных фамилий лежит имя Ермолай, как самое распространённое в народном обиходе.

Фамилия Ермоченков — фонетический вариант фамилии Ермошенкова. Чередование звуков [ш] и [ч] в суффиксе нередко встречается в русских фамилиях: оно связано с особенностями местных говоров или просто с тем, как имя записал писарь. Оба варианта восходят к одному и тому же корню, так что Ермоченков и Ермошенков — по сути родственные фамилии, разошедшиеся в написании.