Фамилия Ерофейкин образована от имени Ерофейка — уменьшительной формы крестильного имени Иерофей. В переводе с греческого Иерофей означает «священный» или «посвященный Богу». Это имя попало в русский именослов вместе с другими православными именами и со временем обросло множеством народных, бытовых форм. Ерофейка — одна из них, и именно она легла в основу фамилии по модели «чей?»: Ерофейкин — буквально «сын Ерофейки».

С точки зрения словообразования фамилия типична для центральных и северных регионов России. Суффикс -ин указывает на принадлежность к конкретному человеку, а не на прозвище по профессии или месту жительства. В документах XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с именем Ерофейка, но фамилия Ерофейкин фиксируется в переписях позже, когда отчества начали закрепляться как наследственные. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые могли образовываться от полных имен, модель на -ин чаще использовалась для производных форм, что делает Ерофейкина характерным примером «матримониальной» фамилии — от имени отца в обиходной форме.

Географически фамилия тяготеет к Вологодской, Костромской и Архангельской областям, где имя Ерофей было особенно распространено. В некоторых говорах имя произносили с ударением на второй слог — Еро́фей, отсюда возможны варианты написания вроде Ерофекин, но основная форма сохранила древнюю уменьшительную основу.

Спорных версий немного: иногда Ерофейкин ошибочно связывают с растением зверобой (в народе «ерофей»), но это позднее переосмысление. Надежнее держаться антропонимического корня — имя Иерофей, прошедшее через народную переработку. Таким образом, носитель фамилии Ерофейкин — потомок человека, которого в быту звали ласково Ерофейкой, и это имя, несмотря на свою уменьшительную форму, несло память о высоком церковном значении: «посвященный Богу».