Фамилия Евгениева — редкий случай, когда в основе лежит не народная форма имени, а полное церковное. В большинстве русских фамилий от имени Евгений пошли Евгеньев, Евгенов, Евгеничев — с усечением или суффиксами, типичными для бытовой речи. А здесь мы видим суффикс -ев, присоединённый прямо к полной канонической основе «Евгени-». Такая модель в крестьянской среде почти не встречалась: она характерна для духовного сословия.

В среде семинаристов и священников было принято образовывать фамилии от имён святых в их полной, книжной форме. Имя Евгений носили несколько раннехристианских мучеников, и будущий священник или его сын мог получить фамилию Евгениев (а его жена или дочь — Евгениева) прямо по имени святого, без переделки на народный лад. Это отличает фамилию от более массовых Евгеньевых, которые могли возникнуть и в крестьянской, и в мещанской среде от просторечного Евгений — Евгень.

Форма на -ева указывает на женскую линию: либо это была жена человека по фамилии Евгениев, либо дочь, вышедшая замуж и сохранившая отцовскую фамилию в женском варианте. В документах XVIII–XIX веков такое написание встречается у вдов и незамужних дочерей священно- и церковнослужителей.

Географически фамилия тяготеет к центральным губерниям России, где было много духовных училищ и семинарий: Владимирская, Костромская, Ярославская. Встречается она крайне редко — по сравнению с Евгеньевыми, которых в десятки раз больше. Это не случайная описка писаря, а осознанный выбор формы, подчёркивающий книжное, а не народное происхождение. Если ваш предок носил фамилию Евгениева, с высокой вероятностью он был связан с церковной средой, где ценили точное следование церковнославянскому написанию имён.