Основой фамилии Фанченко послужило мирское имя Фаня. Фамилия Фанченко восходит к нецерковному имени Фаня, основой для которого могли послужить несколько крестильных имен: Афанасий (от греческого Атанасиа – «бессмертие»), Епифан (от «epifanes» - «видный, известный, знатный»), Митрофан («слава матери», «найденный матерью»), Стефан («венок»), Феофан («богоявленный»). Таким образом, потомок человека, обладающего именем Фаня, со временем получил фамилию Фанченко.