Фамилия Фанков — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить самые поверхностные догадки, сразу ясно: к слову «фан» (поклонник, болельщик) она отношения не имеет — это заимствование позднее, а фамилия формировалась несколько веков назад.

Скорее всего, основа здесь — личное имя или прозвище Фанко. Суффикс -к- в русских именах и прозвищах выполнял уменьшительную или уничижительную функцию. Имя Фанко могло быть производным от канонического имени Фаний (редкое греческое имя, означающее «светлый», «видный») или от просторечного Фаня, которое, в свою очередь, могло быть сокращением от Афанасий или Стефан (через форму Стефания). В народной среде имя легко усекали: Афанасий → Фаня, Степан → Стефаний → Фаня. Фанко — это уже «маленький Фаня» или прозвище по характеру.

Суффикс -ов в фамилии указывает на типичную русскую модель: «чей?» — сын Фанка, потомок Фанко. Окончание закрепилось в XVI–XVII веках, когда фамилии оформлялись по отчеству. Таким образом, первый носитель фамилии Фанков был, вероятно, сыном или внуком человека по имени Фанко.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и западнорусским областям, где была сильна традиция образования прозвищ на -ко (как в украинской среде). Встречается она и в старых списках однодворцев — потомков служилых людей, живших на южных рубежах России. В дворянских родословных книгах Фанковы не зафиксированы, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение.

Есть и более редкая, но правдоподобная версия: фамилия могла возникнуть от прозвища Фанок, связанного с глаголом «фанить» (в диалектах — «веять», «дуть», «махать»). Тогда Фанок — человек, который веет зерно, или просто прозвище ветреного, непостоянного человека. Но эта гипотеза слабее, так как глагол мало распространён.

Итог: Фанков — фамилия-отчество от прозвища или уменьшительной формы редкого имени. Носители её — потомки простых людей, скорее всего, выходцев из южнорусских или украинских земель.