Фамилия Фарафон напрямую связана с именем Ферапонт. В основе лежит просторечная форма Фарафон, которая в некоторых говорах закрепилась как самостоятельное имя. Само же имя Ферапонт происходит от греческого слова therapontos, что означает «спутник, помощник», а также «ученик, слуга». Так что предки носителей этой фамилии, скорее всего, носили имя Фарафон — либо как обиходный вариант церковного имени, либо как его народную переделку.

Интересно, что фамилия образована без типичного суффикса -ов или -ин: она просто застыла в форме имени. Это редкий случай, когда прозвище или имя стало фамилией напрямую, без добавления притяжательного суффикса. Такое встречается нечасто, и это отличает Фарафонов от большинства русских фамилий, которые строятся по модели «чей сын» — Иванов, Петров, Сидоров.

Сама форма Фарафон возникла в живой речи: греческое Ферапонт с его непривычным сочетанием звуков народ переделал на свой лад, заменив «е» на «а» и упростив произношение. Это типичная народная этимология, когда имя адаптируется под привычные звуковые модели русского языка. В документах XVII–XVIII веков можно встретить и Ферапонтов, и Фарафонов, и вот такие «голые» формы, как Фарафон.

Географически фамилия встречается в основном в северных и центральных регионах России, где имя Ферапонт было особенно почитаемо благодаря Ферапонтову монастырю на Вологодчине. Однако именно форма Фарафон чаще фиксируется в южнорусских говорах, где аканье — произношение «а» вместо безударного «о» и «е» — было нормой. Поэтому можно предположить, что предки носителей фамилии происходят из южнорусских земель.

Если говорить о социальном контексте, то носителями имени Фарафон были в основном крестьяне и посадские люди — в дворянской среде предпочитали более книжную форму Ферапонт. Соответственно, и фамилия Фарафон несёт на себе отпечаток простонародной традиции именования. Впрочем, это не делает её «проще» — наоборот, она сохранила живую народную речь тех времён.

Сравните с однокоренными фамилиями: Ферапонтов — более книжный вариант, Фарафонов — уже с суффиксом, а вот Фарафон — редкая «чистая» форма. Встречается также написание Фарафонтьев, но это уже от отчества, а не от прямого имени. Так что если ваша фамилия именно Фарафон, вы носите редкий архаичный след того, как русский язык перекраивал греческие имена под себя.