Фамилия Фартушин происходит от прозвища Фартуша, которое напрямую связано с украинским словом «фартуша» — так на Украине называли фартук, передник. Речь идет о предмете одежды разного кроя и материала, который надевали во время работы, чтобы предохранить одежду спереди от загрязнения. Потомок человека с таким прозвищем со временем и получил фамилию Фартушин.

Слово «фартук» пришло в русский и украинский языки из польского или немецкого (Fahrttuch), где означало «дорожное полотно» или просто кусок ткани. Но в украинских говорах закрепилась именно форма «фартуша» — с характерным для украинского языка смягчением и суффиксом, придающим слову бытовой, даже ласкательный оттенок. Прозвище Фартуша могли дать человеку по разным причинам. Чаще всего — по роду занятий: мельнику, пекарю, кузнецу, повару, то есть любому мастеровому, чья работа была немыслима без передника. Но прозвище могло закрепиться и за неряшливым человеком, который вечно ходил в запачканной одежде, либо, наоборот, за чистюлей, не снимавшим фартук и дома.

Модель образования фамилии простая и типичная для восточнославянской ономастики: к основе Фартуш- добавили притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Вопрос «чей ты будешь?» в крестьянской среде решался однозначно: сын Фартуши — Фартушин. Суффикс -ин характерен для фамилий, образованных от слов, оканчивающихся на -а или -я, в то время как -ов/-ев использовали для основ на согласный. Здесь же основа мягкая, поэтому -ин.

В документах фамилия встречается редко и не имеет громкой истории. Это объяснимо: прозвище носило локальный, бытовой характер и не попало в боярские или дворянские родословные. Скорее всего, Фартушины — потомки ремесленников или крестьян из южнорусских губерний и Украины, где слово «фартуша» было в ходу. Похожие фамилии — Фартуков, Фартушный, Фартушков — встречаются чаще, но Фартушин сохранил именно украинский след в основе.