Фамилия Фарукова — женская форма фамилии Фаруков, и её разбор стоит начать с мужского варианта. В основе лежит мужское имя Фарук, которое восходит к арабскому Фарук (Фару́к), что значит «различающий добро и зло» или «отделяющий истину от лжи». Это одно из почетных прозвищ халифа Умара ибн аль-Хаттаба, второго праведного халифа, известного своей справедливостью и проницательностью. Таким образом, фамилия Фарукова указывает на то, что предок носителя носил имя Фарук — довольно распространенное у тюркских и кавказских народов, принявших ислам.

Суффикс -ов в фамилии Фаруков (и, соответственно, Фарукова) — классическая русская патронимическая модель, означающая «сын (или потомок) Фарука». Такие фамилии массово возникали у крещёных татар, башкир, а также у народов Северного Кавказа, когда их включали в состав Российской империи и фиксировали в документах по русским образцам. Поэтому географически фамилия Фарукова наиболее вероятна в Татарстане, Башкортостане, на Кавказе (особенно у кумыков, ногайцев, черкесов) и в регионах с татарскими диаспорами.

Интересная деталь: в отличие от более частых фамилий на -ов, основа Фарук- не дала большого числа однокоренных вариантов в русской среде. Встречается написание с одной «р» (Фауков) или с ударением на последний слог (Фаруко́ва), но это уже искажения при записи. В некоторых тюркских языках существует форма Фаруков, где ударение падает на «у», что ближе к исходному произношению.

Сословное происхождение фамилии определить сложно: имя Фарук носили и муллы, и крестьяне, и купцы. Если носители фамилии — из татарских или кавказских мусульманских семей, то предки могли быть как духовными лицами, так и обычными земледельцами. Встречается фамилия и у русских, но это почти всегда результат браков или ассимиляции. Так что главный вывод: Фарукова — фамилия, которая через имя предка связывает носителя с арабской культурой и исламской историей, а через суффикс — с русской бюрократической традицией XIX века.