Файсханова — фамилия, в которой основа и суффикс рассказывают о происхождении почти без споров. Это типичная модель для тюркских и татарских фамилий, адаптированных русской грамматикой: корень «Файсхан» плюс русский патронимический суффикс -ов/-ев, который здесь стоит в женской форме -а. Мужской вариант — Файсханов.

Основа «Файсхан» — сложное имя, распространённое у татар и башкир. Первая часть «Файс» (иногда «Фаиз») восходит к арабскому «фаиз» — «победитель», «преуспевающий», «одарённый». Вторая часть «хан» — тюркский титул, означающий правителя, владыку. В составе имён «хан» часто играл роль усилителя, придавая имени значение «великий», «главный» или просто указывая на знатное происхождение. Таким образом, Файсхан можно перевести как «победоносный владыка» или «преуспевающий хан».

Фамилия Файсханова, скорее всего, образована от имени отца или основателя рода. В среде татар и других тюркских народов Поволжья и Приуралья такие составные имена с элементами «хан», «бек», «мурза» были распространены среди служилых людей, купцов и духовенства. Однако сама фамилия не обязательно указывает на аристократическое происхождение — к XIX веку подобные имена носили и крестьяне.

Географически фамилия Файсхановы встречается в Татарстане, Башкортостане, в Оренбургской и Челябинской областях, а также среди татарской диаспоры в Средней Азии. Благодаря суффиксу -ов фамилия хорошо вписалась в русскую паспортную систему, но её тюркская основа остаётся прозрачной и говорит о культурных корнях носителей.